公式を見ると MP4Splitter.ax または MatroskaSplitter.exe を導入してくれとコメントがある。
後者の方がインストールが簡単らしいのだが、色々と変なのを入れるのが嫌なので出来るだけ最小限に留めたい。
この理由から前者のインストールを決行する。

調べてみると 「MP4Splitter.ax」 をSystem32に置きファイルを指定して実行で「regsvr32 MP4Splitter.ax」と入力するといいらしい。
だが、何度やっても

モジュール “MP4Splitter.ax” は読み込まれましたが、DllRegisterServer への呼び出しはエラー コード 0×80070005 により失敗しました。

この問題の詳細については、エラー コードを検索語として入力してオンラインで検索してください。

というエラーが出る。なんだよ、うるせーよ(‘A`)
翌々説明を見てみるとグレーの薄い字で補足があった。

1. 空のテキストファイルに、「regsvr32 MP4Splitter.ax」と入力
2. ファイルを、「register.bat」という名前で保存する。
3. これを、管理者として実行すればよい。
4. アンインストールする時は、「register.bat」の内容を
　「regsvr32 -u MP4Splitter.ax」に変えて、これを管理者として実行する。

それを早く言え。重要な事だろ、むしろred big boldで書け。
VistaだとUAC掛かってる場合は管理者権限でないとインストールできないよなぁ…と必死に “ファイルを指定して実行” 自体を管理者権限で実行しようとしていた。馬鹿だオレｗ

詳しいインストール方法は以下を参考にしたので、ここに載せておきます。

参考：MP4 Splitter – ｋ本的に無料ソフト・フリーソフト